Quelle est la qualité des tests de dépistage génétique?

Considérez votre génome – tout l’ADN de votre corps – comme un gros livre. Vingt-trois chapitres, contenant des centaines de milliers de lettres et des dizaines de milliers de mots, racontent tous votre histoire. Si vous modifiez un paragraphe, une phrase ou même une lettre dans un mot de votre livre, sa lecture sera-t-elle différente? Peut etre ou peut etre pas. Cela dépend de beaucoup de choses, y compris exactement quels mots sont modifiés, où ils se trouvent et qui lit le livre. Le fait est que votre génome est compliqué précisément parce qu’il y a tellement de couches. Et cela fait des tests génétiques directement au consommateur une proposition tout aussi complexe.

Un conte de deux chromosomes

Voici un exemple concret. Il y a quinze ans, nous publié un article sur les couples infertiles avec des problèmes de facteurs masculins azoospermie. Il leur manquait tous le canal déférent, une condition non réparable appelée absence congénitale du canal déférent. Ce n’est pas si rare, survenant chez 1 homme sur 500. Les hommes atteints de cette maladie ne peuvent pas concevoir naturellement, mais peuvent concevoir avec extraction de sperme et FIV.

Mais il y a plus: ces hommes ont un 80% risque de porter une mutation dans le gène de la mucoviscidose (FK). Ils n’ont pas de mucoviscidose, mais leurs enfants pourraient, selon la façon dont les cartes génétiques tombent. Et la mucoviscidose est une maladie très grave et débilitante.

L’un des couples étudiés a été testé pour les mutations du gène CF pour avoir une idée du risque d’avoir un enfant affecté. De façon inattendue, l’homme n’a montré aucune mutation, pas plus que son partenaire. Ils avaient donc l’impression que le risque d’avoir un enfant touché était très faible et ils étaient prêts à avoir un bébé. Mais le test qu’ils ont fait n’a examiné que 32 des mutations les plus courantes (parmi 1600 connu à cette époque) trouvé chez les Caucasiens. Et ils étaient tous deux d’origine asiatique. Nous les avons donc retestés pour toutes les mutations CF connues en clonant essentiellement leurs gènes et, bien sûr, ils ont tous les deux partagé une mutation plus rare. Cela faisait courir le risque que leur enfant souffre de mucoviscidose 25%, un scénario très différent de ce à quoi ils pensaient auparavant.

Mais il y a une bonne nouvelle: en utilisant des tests d’embryon avant l’implantation pour éviter la mucoviscidose, ils ont maintenant un enfant en bonne santé. Le fait est que leurs tests génétiques ont créé un faux sentiment de sécurité qui «tout était clair» dans la transmission d’une maladie grave à la progéniture.

Il ne calcule pas

Très récemment, deux études a averti que les tests génétiques directs au consommateur ne devraient pas être utilisés isolément pour prendre des décisions médicales. Les études américaines et européennes ont révélé que les tests génétiques en vente libre BRCA1 et BRCA2 tests de dépistage (pour le risque de cancer du sein et de l’ovaire) 80-99% des populations ethniquement diverses, une situation qui rappelle celle de notre couple infertile. Les chercheurs impliqués dans les études ont averti que les tests qui suggèrent une augmentation du «risque» génétique ne signifient pas nécessairement qu’une maladie ou un problème se produira. Et, comme cela s’est produit avec notre couple infertile, des résultats rassurants qui suggèrent un risque plus faible ou «tout à fait clair» peuvent être peu fiables ou même carrément faux.

Sachez que votre livre sur la génomique est l’une des lectures les plus complexes imaginables et nécessite une énorme expertise pour comprendre et interpréter correctement. Les évaluations spontanées ne suffisent pas.